На видео говорится, что ничего оскорбительного в термине "секта" нет, и авторы ссылаются на википедию. Но значения слов (или их эмоциональная окраска) могут меняться со временем, как например произошло с вполне нейтральными старинными терминами "жид" (еврей) и "блядь" (заблуждающийся человек).
Термин "секта" - сейчас практически ругательство, негативный ярлык, навешиваемый с целью шельмования и травли какого-либо сообщества (как правило, религиозного). Его применяют, в основном, православные попы, в отношении всех "неправильных" учений. Этот термин - неотъемлемая часть, традиционного для православной церкви, языка ненависти.